建仁寺派 本山建仁寺（京都）
建仁２（1202）年、南宋に留学して帰国した栄西禅師により始まる。臨済宗（黄龍派の禅）を日本にはじめて伝える。
東福寺派 本山東福寺（京都）
嘉禎２（1236）年、南宋に留学して帰国した円爾（弁円）禅師により始まる。楊岐派の禅（以下、同）。
建長寺派 本山建長寺（鎌倉）
建長５（1253）年、中国・宋から招かれた蘭渓道隆禅師により始まる。
円覚寺派 本山円覚寺（鎌倉）
弘安５（1282）年、中国・元から招かれた無学祖元禅師により始まる。
南禅寺派 本山南禅寺（京都）
正応４（1291）年、無関普門禅師により始まる。
国泰寺派 本山国泰寺（富山高岡）
正安２（1300）年頃、慈雲妙意禅師により始まる。
大徳寺派 本山大徳寺（京都）
正和４（1315）年、宗峰妙超禅師により始まる。
妙心寺派 本山妙心寺（京都）
南朝：延元２・北朝：建武４（1337）年、関山慧玄禅師により始まる。末寺3400ケ寺を持つ臨済宗最大の宗派。
天龍寺派 本山天龍寺（京都嵐山）
南朝 : 延元４・北朝 : 暦応２（1339）年、夢窓疎石禅師により始まる。
永源寺派 本山永源寺（滋賀）
南朝 : 正平16・北朝 : 延文６、康安元（1361）年、寂室元光禅師により始まる。
向嶽寺派 本山向嶽寺（山梨塩山）
南朝 : 天授４・北朝 : 永和４（1378）年、抜隊得勝禅師により始まる。
方広寺派 本山方広寺（静岡）
南朝 : 弘和４、元中元・北朝 : 永徳４、至徳元（1384）年、無文元選禅師により始まる。
相国寺派 本山相国寺（京都）
南朝 : 元中９・北朝 : 明徳３（1392）年、夢窓疎石禅師により始まる。
佛通寺派 本山佛通寺（広島三原）
応永４（1397）年、愚中周及禅師により始まる。
興聖寺派 本山興聖寺（京都）
慶長８（1603）年、虚応円耳禅師により始まる。
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